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Octave

软件简介​

Octave是一种开源的数值计算工具，可用于执行各种数值计算任务，包括线性代数、非线性优化、信号处理、图像处理和统计分析等。

前提条件​

请确保在需要运行桌面类应用的机器上安装有：

  • TurboVNC 3.0版本及以上

  • 您需要运行的Octave

1、TurboVNC安装​

wget https://turbovnc.org/pmwiki/uploads/Downloads/TurboVNC.repo --no-check-certificate
mv TurboVNC.repo /etc/yum.repos.d
# 安装最新版本
yum install turbovnc -y

2、Octave安装​

  • octave可以通过conda进行安装，请参考Jupyter应用配置附章中的Anaconda安装。

  • 创建一个新的conda环境，新环境名称格式使用“软件名-版本号”：

    conda create -n octave-7.2.0 -y

  • 激活新创建的环境：

    conda activate octave-7.2.0

  • 安装 Octave：

    conda install octave=7.2.0

下面讲解如何配置使用Octave。

配置文件​

创建config/apps目录，在里面创建octave.yml文件，其内容如下：

config/apps/octave.yml
# 这个应用的ID
id: octave

# 这个应用的名字
name: octave

# 指定应用类型为vnc
type: vnc

# VNC应用的配置
vnc:
  # 准备脚本
  beforeScript: |
    export CONDA_VERSION="anaconda/3-2023.03"
    export SHELL_NAME=$(echo ${SHELL} | awk -F'/' '{print $NF}')

  # 此X Session的xstartup脚本
  xstartup: |
    module switch ${CONDA_VERSION}
    eval "$($(which conda) shell.${SHELL_NAME} hook)"

    conda activate ${octave_version}
    if [ $? -ne 0 ]; then
      exit 1
    fi
    octave --gui
      
# 配置HTML表单
attributes:
  - type: select
    name: octave_version
    label: 选择版本
    select:
      - value: octave-7.2.0
        label: octave-7.2.0
  - type: text
    name: sbatchOptions
    label: 其他sbatch参数
    required: false
    placeholder: "比如：--gpus gres:2 --time 10"

增加了此文件后，刷新WEB浏览器即可。

对于Octave，export以下变量的含义是：

  • SHELL_NAME：当前会话的shell名称

  • CONDA_VERSION：系统默认的conda版本